More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1964 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1964  histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  951    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  37.28 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.89 
 
 		 646 aa  156  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 655 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3597  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 651 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  0.378972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4674  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 651 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.36 
 
 		 675 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  31.35 
 
 		 671 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 415 aa  134  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2763  putative nitrate/nitrite sensor protein  32.83 
 
 		 644 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2685  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.83 
 
 		 644 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2629  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.83 
 
 		 644 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1850  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  32.08 
 
 		 644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0979  putative transmembrane nitrate/nitrite sensor kinase transcription regulator protein  32.66 
 
 		 637 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1735  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  32.66 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1518  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.66 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2245  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.66 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.482228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3073  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.66 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.74 
 
 		 643 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 638 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.39 
 
 		 638 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 748 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.17 
 
 		 636 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 638 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 725 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1168 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.34 
 
 		 644 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1400  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 644 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.324076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  34.17 
 
 		 1809 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.94 
 
 		 637 aa  99.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0603  signal transduction histidine kinase sensor  30.53 
 
 		 707 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0220625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 632 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  31.62 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 692 aa  98.2  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 508 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6191  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 627 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0297171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  32.7 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  28.12 
 
 		 622 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.96 
 
 		 482 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.56 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  32.21 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.43 
 
 		 622 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 640 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.04 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.61 
 
 		 593 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.61 
 
 		 593 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0789  histidine kinase  33.78 
 
 		 273 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0444  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.31 
 
 		 603 aa  93.6  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  29.61 
 
 		 566 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.17 
 
 		 602 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.18 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 370 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 682 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  27.32 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2224  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.09 
 
 		 589 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129909  normal  0.0788983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 485 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 592 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2300  nitrate/nitrite sensor protein NarX  24.72 
 
 		 589 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 553 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.49 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  23.77 
 
 		 372 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  23.77 
 
 		 372 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.74 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03848  Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific  24.53 
 
 		 588 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 546 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  35.27 
 
 		 404 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  24.02 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  23.77 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 1226 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.09 
 
 		 430 aa  91.3  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  24.02 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  31.58 
 
 		 1033 aa  90.9  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  35.35 
 
 		 216 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 1101 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.78 
 
 		 325 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  31.74 
 
 		 799 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 517 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3489  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 560 aa  90.1  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0416624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 799 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  33.75 
 
 		 384 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.3 
 
 		 797 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.9 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>