More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5166 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  54.93 
 
 		 615 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 640 aa  1293    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  48.84 
 
 		 921 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  39 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 636 aa  142  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 661 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  26.36 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  24.24 
 
 		 619 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 624 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  25.38 
 
 		 659 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.47 
 
 		 626 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 		 614 aa  100  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 652 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 658 aa  94.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 469 aa  90.5  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 614 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.18 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  31 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.49 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  32.24 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  32.24 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  28.57 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 610 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 742 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.15 
 
 		 1033 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  26.51 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  30.08 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 652 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.59 
 
 		 462 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  32.8 
 
 		 448 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  32.23 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  29.13 
 
 		 797 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  26.67 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 770 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 1226 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 1229 aa  74.7  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  22.47 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 463 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 801 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  31.6 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.6 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.28 
 
 		 1101 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  33.21 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34 
 
 		 381 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.77 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 550 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 352 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1317  sensory box sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 353 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  26.92 
 
 		 483 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  29.03 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  26.95 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1248  signal transduction histidine kinase-like protein  28.89 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.52923  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  27.95 
 
 		 799 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  29.44 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29.78 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.02 
 
 		 482 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 382 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0077  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  28 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  26.18 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  26.36 
 
 		 1031 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  27.19 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.83 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>