More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1248 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1248  signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 768 aa  1523    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.52923  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  32.18 
 
 		 619 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  31.64 
 
 		 625 aa  96.3  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 703 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  28.8 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 684 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 700 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.03 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  26.84 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  32.29 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  30.33 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 703 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.99 
 
 		 431 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  29.05 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5475  histidine kinase  26.15 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 448 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 606 aa  71.6  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  29.26 
 
 		 1063 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  31.89 
 
 		 573 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  28.57 
 
 		 657 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 366 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  29.49 
 
 		 921 aa  69.7  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 372 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 775 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  27.52 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  25.31 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 1168 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 376 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 376 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  27.09 
 
 		 783 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  28.9 
 
 		 288 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  28.84 
 
 		 458 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  26.34 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 407 aa  67.4  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  23.58 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 624 aa  67.4  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  28.44 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  28.82 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 		 730 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 661 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.67 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  26.75 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  30.29 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  27.36 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  29.49 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  31.82 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  31.3 
 
 		 591 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 363 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  28.88 
 
 		 381 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.02 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  26.96 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  28.5 
 
 		 278 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  29.32 
 
 		 671 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  26.16 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.57 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  30.45 
 
 		 772 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>