More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0853 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1167    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  29.02 
 
 		 395 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 385 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 595 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  23.96 
 
 		 595 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  24.42 
 
 		 595 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  23.96 
 
 		 592 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.42 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  28.21 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  24.03 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.69 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.45 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  29.74 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  25.73 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  26.64 
 
 		 378 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  27.01 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  24.78 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.37 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  26.92 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  27.04 
 
 		 1033 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  28.2 
 
 		 799 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  27.45 
 
 		 374 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  25.42 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  29.53 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  23.39 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  29.36 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  26.47 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  25.54 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  24.02 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.13 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  26.24 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 372 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  24.14 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 606 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  25.25 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  25.99 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  24.79 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  25.52 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  24.89 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 869 aa  74.3  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  27.47 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  27.55 
 
 		 797 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  25.39 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  24.41 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  25.59 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  25.52 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 366 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 742 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  25 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  21.39 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  24.22 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  26.56 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  27.03 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.93 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  27.18 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  23.23 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  24.69 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  24.36 
 
 		 332 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.63 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  24.79 
 
 		 399 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  27.14 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  26.7 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  25 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.26 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  23.38 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.55 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>