More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0940 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 614 aa  1211    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 618 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 652 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 652 aa  153  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 636 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.91 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  29.42 
 
 		 657 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 624 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  27.34 
 
 		 659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  26.05 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  28.63 
 
 		 626 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 614 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 615 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  29.87 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  26.17 
 
 		 921 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 645 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.89 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  27.98 
 
 		 1036 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.55 
 
 		 1033 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  29.09 
 
 		 1031 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.64 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  26.11 
 
 		 1017 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 682 aa  67  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  27.9 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25.33 
 
 		 625 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  28.7 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.2 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  24.62 
 
 		 1093 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  27.88 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  30.86 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  26.34 
 
 		 1037 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  32.46 
 
 		 620 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  28.3 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 305 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  28.63 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  25.77 
 
 		 1048 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  30.69 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  30.65 
 
 		 356 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 795 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 490 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  30.37 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  30.88 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0343  putative signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  24.09 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  31.55 
 
 		 467 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  21.63 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  22.45 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  30.43 
 
 		 407 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  29.95 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  27.04 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.68 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 344 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  22.95 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  31.19 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  30 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  31.19 
 
 		 1013 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1567  histidine kinase  28 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.83 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 1648 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.83 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.15 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.08 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  23.64 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  29.86 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  29.86 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>