More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3160 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 626 aa  1260    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  70.45 
 
 		 657 aa  834    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 652 aa  475  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  47.54 
 
 		 659 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 652 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 614 aa  160  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 618 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 614 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 645 aa  140  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  27.68 
 
 		 921 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  27.24 
 
 		 626 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  28.53 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  24.11 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 476 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 640 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 615 aa  100  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  31.67 
 
 		 967 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  30.39 
 
 		 1031 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  22.3 
 
 		 625 aa  90.9  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  31.67 
 
 		 404 aa  90.5  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  30.37 
 
 		 1037 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.53 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.72 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  29.68 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 658 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  27.38 
 
 		 638 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4738  histidine kinase  28.03 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.977544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  32.14 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  26.64 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  29.15 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.62 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  29.5 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.41 
 
 		 646 aa  77  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  31.56 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  31.14 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  27.75 
 
 		 491 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  28.33 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  31.34 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  28.99 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4642  putative signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  31.6 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29.39 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  26.64 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  25.71 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  30.49 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  31.07 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.19 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  26.59 
 
 		 1048 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  29.41 
 
 		 659 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  25.31 
 
 		 1033 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 461 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  22.22 
 
 		 1046 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 381 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  29.65 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 779 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 381 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  25.31 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>