More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1239 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 358 aa  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0564  histidine kinase  36.21 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0641  signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 450 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10700  signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0148  histidine kinase-related ATPase, putative  35.56 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 401 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 513 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  26.23 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.98 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.77 
 
 		 515 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 407 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  27.16 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 467 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  27.51 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  24.79 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 459 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  24.54 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  22.96 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  27 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  26.84 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  26.96 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.86 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  24.68 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  30.56 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.48 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30.73 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.21 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  24.12 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  28.93 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  30.46 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 742 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.69 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  28.08 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  25.9 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  22.59 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  27.36 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0853  putative signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000112347  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.99 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  24.53 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  28.42 
 
 		 1031 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  29.65 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 671 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  26 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 684 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  25.55 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 703 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 707 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  27.52 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  26.05 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  30.14 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  25.51 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>