More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4249 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4249  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
579 aa  1165    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 
738 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
616 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
1039 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
1034 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
785 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.93 
 
 
887 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
708 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.71 
 
 
531 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3269  diguanylate cyclase  23.94 
 
 
492 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  24.55 
 
 
588 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
593 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
893 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 
566 aa  98.2  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 
882 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
596 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  22.61 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
671 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.94 
 
 
531 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
480 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.27 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
763 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  26.3 
 
 
687 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
700 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
700 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  26.87 
 
 
619 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
654 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  26.87 
 
 
680 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  26.87 
 
 
680 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  25.24 
 
 
683 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.54 
 
 
557 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 
795 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
795 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
703 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
795 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
594 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
703 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  19.67 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
684 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.29 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
564 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  26.46 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
665 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  28.19 
 
 
671 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  29.18 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  29.76 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.21 
 
 
1033 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  30.81 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
801 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  32.99 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.84 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
775 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.74 
 
 
598 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
1168 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
799 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  29.8 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  22.05 
 
 
693 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  32.38 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
610 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.84 
 
 
860 aa  67  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4221  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.87 
 
 
543 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.363581  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
541 aa  67  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.9 
 
 
1048 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  28.51 
 
 
356 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  28.25 
 
 
670 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
450 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  23.39 
 
 
582 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
673 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  26.79 
 
 
797 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
509 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  31.94 
 
 
388 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  29.91 
 
 
368 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.51 
 
 
466 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
466 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>