More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1654 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  62.14 
 
 		 572 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 567 aa  1115    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  69.77 
 
 		 591 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  66.73 
 
 		 566 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  57.9 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  49.1 
 
 		 573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 573 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 580 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  45.7 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.94 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  42.43 
 
 		 578 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 559 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 556 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 631 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  42.5 
 
 		 573 aa  333  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 543 aa  331  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  41.57 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  38.21 
 
 		 543 aa  297  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  34.96 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 535 aa  276  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 590 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  33.33 
 
 		 635 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  39.89 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  53.55 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  35.28 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.64 
 
 		 391 aa  173  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 381 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 665 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.13 
 
 		 851 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 386 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.16 
 
 		 828 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  40.49 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.84 
 
 		 373 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 		 673 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 393 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 		 535 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 		 795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 373 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.97 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.97 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.97 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.97 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.97 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  36.19 
 
 		 598 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  36.1 
 
 		 382 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  35.91 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  35.91 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  35.91 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  35.91 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  35.91 
 
 		 598 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  33.03 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  31.88 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  33.03 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.03 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 598 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.92 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 725 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 709 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 958 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 582 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 1017 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 464 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 345 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>