165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4670 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
143 aa  289  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  39.26 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  36.88 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.14 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  39.67 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  40 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  36.04 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  42.22 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.61 
 
 
240 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  36.17 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  48.48 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  55.36 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  34.59 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  55.36 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
394 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.67 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  47.37 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  50.91 
 
 
194 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  48.15 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 
169 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  50.88 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  38.1 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  31.3 
 
 
578 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  47.46 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  43.86 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  37.23 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  43.48 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  49.12 
 
 
445 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  45.16 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  47.37 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 
847 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  43.1 
 
 
515 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.62 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  52.63 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  39.29 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  36 
 
 
466 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  41.94 
 
 
70 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 
110 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 
68 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
61 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
419 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
427 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  36.84 
 
 
61 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  36.84 
 
 
61 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  38.16 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  38.6 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 
477 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  43.33 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 
474 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
440 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 
452 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
458 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  39.13 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  38.75 
 
 
233 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 
512 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 
547 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  31.43 
 
 
582 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  40.28 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  35 
 
 
419 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>