More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0139 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0139  histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  855    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.78 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  28.34 
 
 		 903 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.78 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  31.92 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  29.54 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0872586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  29.57 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3275  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  29.39 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  32.46 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  26.42 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  29.35 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  29.19 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  29.91 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  29.19 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00545163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  26.27 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  23.48 
 
 		 986 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 985 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  27.12 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.58 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  25 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  23.79 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  29.31 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  31.58 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  30.39 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  26.54 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  25.47 
 
 		 469 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 911 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 714 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  26.67 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  26.67 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  29.46 
 
 		 826 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.31 
 
 		 710 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  28.35 
 
 		 885 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 974 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 663 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  26.29 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  27.3 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  26.24 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 981 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  hitchhiker  0.00733319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  28.51 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  25.84 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  25.93 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  26.39 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  25.93 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  25.93 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  25.93 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.02 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  25.93 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 873 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 761 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2192  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  22.89 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 620 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  22.93 
 
 		 595 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  26.13 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 525 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>