More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0988 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  100 
 
 		 486 aa  939    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  37.5 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.21 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 639 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 641 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  38.52 
 
 		 593 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.5 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 639 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  33.14 
 
 		 855 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 604 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  34.32 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.43 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  32.57 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 640 aa  153  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  35.88 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 396 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  36.01 
 
 		 501 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.14 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 827 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.63 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.78 
 
 		 1162 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 493 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.75 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 		 1133 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  28.29 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.46 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.9 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.55 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.16 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.55 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.64 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  32.16 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  32.16 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 845 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  32.16 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.16 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.16 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  35.2 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 370 aa  144  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.14 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.36 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 466 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.85 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  37.1 
 
 		 594 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.14 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.85 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.01 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.72 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.87 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.75 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.85 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.14 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 570 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  27.84 
 
 		 337 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.45 
 
 		 364 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>