More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2709 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  52.83 
 
 		 845 aa  887    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  100 
 
 		 855 aa  1736    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 829 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2193  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 1196 aa  464  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 977 aa  228  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 1240 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 919 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 1075 aa  212  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 917 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.32 
 
 		 1014 aa  211  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  44.53 
 
 		 565 aa  210  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  38.01 
 
 		 917 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.56 
 
 		 917 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 791 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 917 aa  209  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  42.55 
 
 		 641 aa  208  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 646 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 917 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.39 
 
 		 925 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  37.39 
 
 		 925 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.39 
 
 		 1346 aa  204  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 		 835 aa  204  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  39.21 
 
 		 651 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 916 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 782 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.06 
 
 		 651 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 575 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 1069 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  41.78 
 
 		 923 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 643 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 743 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  37.17 
 
 		 998 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 827 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 1145 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 		 1369 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  39 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 922 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 833 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 		 969 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.46 
 
 		 835 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.06 
 
 		 918 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.06 
 
 		 918 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.06 
 
 		 918 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 690 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 		 985 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.06 
 
 		 918 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 		 631 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 535 aa  199  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.06 
 
 		 918 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.08 
 
 		 705 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 970 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  38.1 
 
 		 833 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  42.86 
 
 		 810 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 1029 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  36.14 
 
 		 526 aa  197  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 643 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.37 
 
 		 620 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  35.09 
 
 		 942 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  37.35 
 
 		 905 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.5 
 
 		 882 aa  197  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 		 846 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 1452 aa  196  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 767 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 1266 aa  196  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 645 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.46 
 
 		 803 aa  195  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  46.46 
 
 		 792 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 643 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.81 
 
 		 935 aa  195  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.74 
 
 		 645 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 721 aa  194  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 933 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.76 
 
 		 918 aa  195  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 932 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 933 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.81 
 
 		 935 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 977 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 933 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 		 1155 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  39.53 
 
 		 641 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  44.36 
 
 		 716 aa  194  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 643 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.21 
 
 		 937 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1643 aa  194  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  44.44 
 
 		 847 aa  194  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 574 aa  193  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 583 aa  193  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  46.12 
 
 		 698 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 932 aa  193  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 937 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 750 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>