More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0650 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  100 
 
 
496 aa  1015    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.5 
 
 
499 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  39.72 
 
 
506 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
488 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
488 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
497 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
498 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
490 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
498 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
504 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
493 aa  256  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
508 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  37.03 
 
 
498 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
498 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
498 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  33.47 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
493 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
487 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  30.71 
 
 
501 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  33.18 
 
 
504 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
485 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
489 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
480 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
480 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  31.14 
 
 
494 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
487 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
473 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  34.32 
 
 
486 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
604 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  28.78 
 
 
457 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.37 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
470 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
639 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
462 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
484 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
597 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
597 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.57 
 
 
501 aa  143  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  29.71 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
365 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
641 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  30.17 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
413 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.17 
 
 
456 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
484 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
467 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
484 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
571 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
484 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
639 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
484 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
3470 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
528 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
639 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
471 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.5 
 
 
508 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
471 aa  136  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
504 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  31.91 
 
 
540 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
1010 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
332 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
799 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.74 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
364 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.74 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
982 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
359 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  31.56 
 
 
370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.97 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
687 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.16 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
815 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
371 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  30.45 
 
 
1361 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  25.97 
 
 
463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.52 
 
 
466 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.41 
 
 
463 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
2153 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
462 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.41 
 
 
463 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.41 
 
 
463 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  31.37 
 
 
466 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31.52 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  33.33 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>