More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1171 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 356 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  95.79 
 
 		 356 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  61.63 
 
 		 890 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  62.65 
 
 		 885 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  63.11 
 
 		 889 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  63.52 
 
 		 892 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  62.7 
 
 		 888 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 522 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 907 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 901 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 897 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  45.6 
 
 		 905 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 		 887 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 		 887 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 894 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 905 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 900 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 912 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 902 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  42.97 
 
 		 910 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 897 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  46.53 
 
 		 905 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  42.42 
 
 		 539 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 902 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  45.68 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 905 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 895 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 907 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  44.08 
 
 		 907 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.15 
 
 		 902 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 902 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.55 
 
 		 895 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 896 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 897 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1460  ATP-binding region ATPase domain protein  30.43 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 907 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 887 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  42.08 
 
 		 887 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 496 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  37.59 
 
 		 908 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 867 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  37.59 
 
 		 908 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  43.61 
 
 		 902 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  37.59 
 
 		 908 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  169  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  40.4 
 
 		 895 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 894 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  40.4 
 
 		 894 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  38.04 
 
 		 897 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  39.22 
 
 		 895 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 883 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 867 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  40.8 
 
 		 894 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 884 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3503  histidine kinase  38.92 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  40.4 
 
 		 894 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 884 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  40.24 
 
 		 895 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001286  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  30.77 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  40.44 
 
 		 497 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  41.1 
 
 		 885 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 884 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  40.91 
 
 		 905 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  41.55 
 
 		 885 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  37.96 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 884 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  39.84 
 
 		 909 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  39.59 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 850 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 640 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 902 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  33.02 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  39.16 
 
 		 910 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  37.4 
 
 		 886 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.78 
 
 		 857 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  39.17 
 
 		 874 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 945 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  38.21 
 
 		 913 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0060  ATPase domain-containing protein  31.89 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000213269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  38.19 
 
 		 914 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 897 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 891 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 836 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 836 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3552  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 402 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>