More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3275 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  831    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0872586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3275  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  100 
 
 		 420 aa  831    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  40.77 
 
 		 442 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  31.58 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  41.73 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.41 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  29.77 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.18 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  30.37 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  30.11 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0107  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0106  sensor histidine kinase  32.8 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  28.34 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  30.52 
 
 		 438 aa  172  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.28 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  39.22 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  38.81 
 
 		 440 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  38.03 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  29.21 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  29.26 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  30.43 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  28.28 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  28.44 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  27.46 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  32.73 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  37.54 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  33.44 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  28.7 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  30.82 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  28.54 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  27.79 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  28.6 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  27.91 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  28.02 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  29.49 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  31.34 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  29.35 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  29.49 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 486 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  27.27 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  29.49 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  30.68 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  31.34 
 
 		 522 aa  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 437 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  30.51 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  30.18 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  29.95 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  30.18 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  28.83 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  30 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  30 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  30.09 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  30.09 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  30 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  30 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  31.42 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  30 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  35.07 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 449 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  39.72 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 474 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  29.48 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  29.18 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  28.15 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  29.27 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>