More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5250 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87 
 
 		 449 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  91.39 
 
 		 452 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  91.26 
 
 		 445 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  91.39 
 
 		 452 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.13 
 
 		 453 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.81 
 
 		 453 aa  875    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  91.26 
 
 		 445 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  91.03 
 
 		 445 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  91.03 
 
 		 445 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 453 aa  902    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  91.26 
 
 		 445 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.22 
 
 		 449 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87 
 
 		 449 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.23 
 
 		 453 aa  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  91.03 
 
 		 445 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  98.68 
 
 		 453 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  96.69 
 
 		 453 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.23 
 
 		 453 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.46 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  55.43 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.2 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  53.92 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.84 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  42 
 
 		 471 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 509 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.69 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  40.91 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 501 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  42.24 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  41.45 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 458 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  42.28 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 505 aa  296  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  40.83 
 
 		 433 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  42.34 
 
 		 471 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.78 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  36.29 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  35 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  32.96 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  33.64 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  33.11 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  41.73 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  42.65 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  35.03 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  41.37 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  41.88 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  32.23 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  41.01 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  32.95 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  33.41 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.96 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  33.41 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.73 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  32.5 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  40.07 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  33.18 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  33.41 
 
 		 450 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.87 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  40.43 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.94 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.94 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  33.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  32.2 
 
 		 430 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.71 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  39.21 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  32 
 
 		 448 aa  172  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.28 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  33.1 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.99 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  32.56 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.99 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.9 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  33.72 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  38.35 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  32.44 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  37.99 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  30.81 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 417 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>