More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0574 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  100 
 
 
429 aa  859    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.25 
 
 
427 aa  725    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  57.18 
 
 
431 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
428 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  57.14 
 
 
428 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
438 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
438 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 
438 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
438 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
446 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  46.26 
 
 
438 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  45.07 
 
 
437 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  45.07 
 
 
437 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 
437 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  45.07 
 
 
437 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  45.07 
 
 
437 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
439 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  45.07 
 
 
437 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  45.07 
 
 
437 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
421 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  44.84 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
417 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  38.89 
 
 
425 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
425 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
437 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.82 
 
 
423 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
423 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
415 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  39.58 
 
 
442 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 
446 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
429 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  32.39 
 
 
438 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  32.95 
 
 
438 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.21 
 
 
438 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.81 
 
 
438 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  31.79 
 
 
445 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  32.39 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
438 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  32.63 
 
 
436 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  31.35 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  31.35 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  31.35 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  31.35 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  31.35 
 
 
445 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  30 
 
 
438 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  32.02 
 
 
436 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  31.39 
 
 
452 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  31.39 
 
 
452 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  32.41 
 
 
438 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  32.23 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  31.17 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  29.16 
 
 
430 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
449 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
453 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
453 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.3 
 
 
470 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.49 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.49 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  32.5 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  30.6 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  32.04 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  32.75 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  31.94 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  32.55 
 
 
447 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  32.55 
 
 
447 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  32.55 
 
 
447 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  32.55 
 
 
447 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
453 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  32.46 
 
 
440 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.74 
 
 
437 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  31.22 
 
 
450 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
453 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
449 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  31.87 
 
 
450 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
443 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  31.87 
 
 
450 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 
453 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.75 
 
 
453 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  31.59 
 
 
450 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
449 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  32.64 
 
 
448 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.96 
 
 
439 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.43 
 
 
449 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  29.13 
 
 
500 aa  156  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.89 
 
 
430 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.33 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>