More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3638 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  76.15 
 
 		 438 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  76.5 
 
 		 438 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  76.92 
 
 		 429 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  100 
 
 		 436 aa  889    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  76.96 
 
 		 438 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  75.06 
 
 		 438 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  83.45 
 
 		 436 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  83.94 
 
 		 436 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  76.91 
 
 		 438 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  80.88 
 
 		 440 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  78.11 
 
 		 438 aa  715    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  71.1 
 
 		 438 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  78.34 
 
 		 438 aa  715    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  74.25 
 
 		 446 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  77.42 
 
 		 438 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  56.02 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  53.02 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  48.52 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  44.47 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  44.47 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  44.24 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  44.24 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  44.24 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  44.24 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  44.24 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  44.01 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  44.39 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  46.88 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  43.09 
 
 		 448 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  42.99 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  42.6 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  42.6 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  42.6 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  42.5 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  45.16 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  42.27 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  44.78 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  42.99 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  42.59 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  41.18 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  36.28 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  40.29 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  43.22 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  37.86 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  38.15 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  38.24 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  34.18 
 
 		 453 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.33 
 
 		 453 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  33.24 
 
 		 523 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  32.78 
 
 		 522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  39.78 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  36.18 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  41.52 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  42.34 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  40.79 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  33.71 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  30.49 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 501 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  32.5 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>