More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0199 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  73.73 
 
 		 522 aa  675    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  72.19 
 
 		 523 aa  680    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 486 aa  1004    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  35.38 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  35.16 
 
 		 440 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  32.33 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  32.87 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  30.7 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.67 
 
 		 432 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  30.7 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  34.15 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.05 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  30.91 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  30.91 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  30.42 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  30.91 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  30.49 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.35 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  30.49 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  30.49 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  30.49 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  30.92 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  33.97 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.17 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  30.28 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  32.78 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  33.6 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  32.59 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  31 
 
 		 444 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  33.61 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  31.48 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  33.9 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  33.9 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  33.05 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  33.24 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  33.24 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  33.9 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  33.24 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.33 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.08 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  32.88 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  32.21 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  31.49 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  35 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  32.59 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  33.51 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  30 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  33.52 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  33.5 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  30.79 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.42 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  31.98 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 509 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  31.06 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  30.26 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  29.41 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3275  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.78 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0872586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  29.23 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  28.27 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>