More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4362 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  76.15 
 
 		 501 aa  707    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  76.89 
 
 		 500 aa  711    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 509 aa  1032    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.94 
 
 		 501 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.79 
 
 		 505 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  63.48 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.5 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.4 
 
 		 459 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 		 458 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  58.03 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  52.16 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.37 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  44.93 
 
 		 449 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 449 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  43.28 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 449 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  41.67 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  40.56 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 449 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  39.73 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  39.73 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  40.09 
 
 		 445 aa  329  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  40.33 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  40.33 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  40.33 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  40.33 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  36.09 
 
 		 471 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.26 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  34.39 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  31.96 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  31.89 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  32.71 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  33.03 
 
 		 436 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  30.8 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.03 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  31.51 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.34 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  31.12 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.96 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.09 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.5 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  31.03 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  30.89 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.73 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  30.43 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  30.56 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  34.23 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.21 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.97 
 
 		 430 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.18 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.86 
 
 		 450 aa  156  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.86 
 
 		 450 aa  156  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  32.84 
 
 		 450 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  31.95 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  31.67 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.58 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  32.95 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  33.05 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 447 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  33.7 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  31.94 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  27.42 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.92 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  31.62 
 
 		 459 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  28.22 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  31.81 
 
 		 437 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  32.13 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  31.81 
 
 		 437 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>