More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5961 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  95.76 
 
 		 425 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.76 
 
 		 425 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.5 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  38.14 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  40.23 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  40.23 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  38.66 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.77 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  40.47 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  40.14 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 438 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.61 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  32.19 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  34.52 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  34.52 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  32.51 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  34.75 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  33.81 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  33.81 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  31.72 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  33.21 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  31.31 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  32.86 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  31.38 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  33 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  34.84 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  35.54 
 
 		 522 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  32.99 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  35.49 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  34.86 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  34.74 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  28.95 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  32.13 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  34.81 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  31.49 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.62 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 501 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  34.8 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  35.52 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 453 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  30.33 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.57 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  31.07 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.57 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  34.52 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  31.21 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.25 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 535 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.02 
 
 		 453 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 449 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  35.89 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>