More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3495 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 417 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.28 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  47.97 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.71 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.14 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 438 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  41.04 
 
 		 438 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  40.52 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 439 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.43 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  40.43 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  37.05 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.43 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.43 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  40.66 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  39.68 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  40.66 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  41.08 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  30.49 
 
 		 442 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  30.45 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.22 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  31.86 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  34.54 
 
 		 444 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  32.26 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  33.22 
 
 		 436 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  32.03 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  30.95 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  32.71 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  30.65 
 
 		 445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  36.26 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  30.36 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  33.33 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  35.27 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  32.71 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  35.27 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  33.45 
 
 		 523 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  36.05 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  28.62 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  31.76 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.97 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  30.38 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  32.03 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  31.41 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  30.03 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  31.89 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  34.93 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  31.7 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  33.57 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  30.12 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 486 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.13 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.73 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.56 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  30.97 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 462 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  31.73 
 
 		 438 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  31.73 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  35.29 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>