More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4298 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  100 
 
 		 428 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  82.94 
 
 		 431 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 428 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  57.14 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  42.66 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 421 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  42.62 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  42.62 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  43.33 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  43.33 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  43.33 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  43.33 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  42.62 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  38.22 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.89 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  35.73 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.08 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.72 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.72 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.47 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  33.12 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  30.59 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.52 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  32.47 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.82 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  32.28 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  31.82 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  35.31 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  34.05 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.32 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  31.19 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  33.23 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  29.4 
 
 		 523 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.25 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  31.69 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.04 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.58 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  28.64 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  34.67 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  32.31 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  28.7 
 
 		 446 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  34.98 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  31.7 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  32.31 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  32.31 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  32.31 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  32.31 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  37.13 
 
 		 276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  32.17 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  31.99 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  31.88 
 
 		 450 aa  146  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.58 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.58 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  31.58 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  31.27 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.55 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  28.84 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  29.08 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  37.4 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  32.09 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>