More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14051 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
444 aa  883    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.06 
 
 
441 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  34.47 
 
 
428 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
428 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.47 
 
 
431 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
417 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.06 
 
 
442 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
427 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
423 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  36.27 
 
 
429 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.53 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.53 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.53 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.53 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
439 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
437 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
438 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
446 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
437 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.48 
 
 
470 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
439 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.27 
 
 
423 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
437 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
438 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  32.86 
 
 
438 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
438 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.34 
 
 
437 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
438 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  33.01 
 
 
453 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  33.03 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  33.01 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  36.25 
 
 
471 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  37.5 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  31.05 
 
 
444 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
448 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  31.32 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  32 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  31.03 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
438 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  29.97 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  29.57 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.71 
 
 
449 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
450 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.67 
 
 
436 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  31.56 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  29.04 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  30.89 
 
 
450 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.42 
 
 
430 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  34.47 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
488 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.88 
 
 
453 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 
450 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  29.43 
 
 
436 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
488 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  30.26 
 
 
440 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
435 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.83 
 
 
450 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  34.96 
 
 
438 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.87 
 
 
438 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
453 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  29.69 
 
 
435 aa  124  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.39 
 
 
429 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.05 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  30.39 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.84 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.04 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  28.81 
 
 
446 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  31.1 
 
 
438 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  32.39 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  30 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  30.08 
 
 
523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.88 
 
 
444 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>