More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0894 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  95.41 
 
 
437 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  94.72 
 
 
437 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.79 
 
 
438 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  83.33 
 
 
438 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  94.72 
 
 
437 aa  785    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.65 
 
 
438 aa  722    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  94.95 
 
 
437 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.97 
 
 
439 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.88 
 
 
438 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  100 
 
 
437 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.93 
 
 
438 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  75.52 
 
 
439 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  95.41 
 
 
437 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.9 
 
 
421 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  94.72 
 
 
437 aa  785    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  94.72 
 
 
437 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.42 
 
 
438 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.15 
 
 
446 aa  631  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
427 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  44.84 
 
 
429 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  44.86 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  42.62 
 
 
428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
428 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
437 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  40.47 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
415 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
423 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.48 
 
 
423 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
425 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
425 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  35.48 
 
 
438 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  35.78 
 
 
442 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  30.82 
 
 
446 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  31.13 
 
 
440 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  33.72 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  30.59 
 
 
436 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  32.32 
 
 
440 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  35.8 
 
 
429 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.56 
 
 
438 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  34.8 
 
 
438 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  35.8 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  30.57 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  30.8 
 
 
438 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  33.88 
 
 
437 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  35.6 
 
 
438 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.34 
 
 
438 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  30.34 
 
 
438 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 
438 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  30.12 
 
 
436 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
436 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  32.4 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  30.93 
 
 
450 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  32.17 
 
 
439 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 
432 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.6 
 
 
430 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 
453 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.84 
 
 
470 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.6 
 
 
430 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 
453 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.84 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  32.45 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  29.03 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  32.21 
 
 
471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  32.75 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  31.46 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  34.06 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
449 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
445 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
445 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
445 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
445 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
453 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.37 
 
 
452 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  32.09 
 
 
445 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.8 
 
 
434 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  32.74 
 
 
435 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
453 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 
447 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 
447 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 
447 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 
447 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 
447 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  31.66 
 
 
453 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  29.52 
 
 
448 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
449 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
453 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
453 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  34.2 
 
 
433 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  29.23 
 
 
450 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
453 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
437 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
453 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>