More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1840 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  875    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  58.06 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  32.05 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.77 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.16 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  34.97 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  37.75 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.28 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.16 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  34.36 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  34.36 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.96 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.96 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.96 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  33.96 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  35.23 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 465 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  32.09 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.27 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  31.23 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  30.51 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  31.53 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  33.9 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  33.56 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.18 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  32.37 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  28.85 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  29.1 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.37 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  29.1 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1288  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  30.3 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30.45 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.02 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  29.81 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  30.41 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  37.1 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  31.31 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.7 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  30.95 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  32.06 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  31.53 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  29.37 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  29.37 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  29.37 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  29.37 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  29.37 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  29.34 
 
 		 448 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.53 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  29.74 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  27.48 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  33.89 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  29.8 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.46 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  33.46 
 
 		 439 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  28.99 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 535 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.39 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  31 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>