More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0372 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.55 
 
 		 437 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 		 423 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.33 
 
 		 423 aa  762    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  38.03 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  40.18 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 438 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  38.05 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 439 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  41 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  41 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.62 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  40.62 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.62 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.62 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.81 
 
 		 437 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.62 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  37.12 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.01 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  32.95 
 
 		 439 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  32.95 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  31.34 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  31.57 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  31.56 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  31.4 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  30.94 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  30.72 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  30.58 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.34 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  31.35 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  29.97 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  29.34 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.74 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.13 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  31.13 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.19 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.87 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  30.9 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  29.87 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  29.87 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.04 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  27.6 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  28.48 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.52 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  32.1 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1288  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.64 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  33.81 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  32.14 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.05 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  30.07 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  32.95 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  32.74 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  32.98 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.41 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  33.92 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  32.74 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  32.74 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  32.73 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  32.73 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  32.74 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  32.74 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>