More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1573 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  99.31 
 
 
437 aa  867    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  100 
 
 
437 aa  873    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.21 
 
 
438 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  100 
 
 
437 aa  873    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.32 
 
 
446 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  99.31 
 
 
437 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  100 
 
 
437 aa  873    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  81.92 
 
 
438 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.61 
 
 
438 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  94.72 
 
 
437 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  83.3 
 
 
438 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  100 
 
 
437 aa  873    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  74.94 
 
 
439 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  99.31 
 
 
437 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.69 
 
 
439 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.52 
 
 
438 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.48 
 
 
421 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  81.69 
 
 
438 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
427 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  45.07 
 
 
429 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  44.76 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
428 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  43.09 
 
 
428 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
417 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
437 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.62 
 
 
423 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
423 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
415 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  39.53 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  32.56 
 
 
438 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
440 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  34.43 
 
 
440 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  35.12 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.41 
 
 
442 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  31.37 
 
 
440 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.91 
 
 
429 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  30.59 
 
 
446 aa  187  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  30.21 
 
 
438 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  33.49 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  30.75 
 
 
438 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.07 
 
 
438 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.68 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  30.84 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.31 
 
 
438 aa  183  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.84 
 
 
438 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  32.87 
 
 
439 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  30.35 
 
 
436 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  32.87 
 
 
439 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  34.17 
 
 
438 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  30.54 
 
 
436 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  30.59 
 
 
436 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  30.93 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  31.15 
 
 
450 aa  173  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  31.15 
 
 
450 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  33.91 
 
 
430 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  30.47 
 
 
453 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  30.3 
 
 
470 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  32.05 
 
 
453 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  32.06 
 
 
471 aa  170  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.97 
 
 
453 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
453 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  30.23 
 
 
453 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
437 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
437 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
449 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
437 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  28.83 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  33.14 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  32.11 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  35.21 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  30 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.1 
 
 
434 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  31.43 
 
 
500 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
452 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
445 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
453 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
452 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
445 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
445 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
437 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
445 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  31.96 
 
 
445 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  32.19 
 
 
453 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
453 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
453 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
453 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  34.53 
 
 
433 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  32.19 
 
 
445 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
459 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
472 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 
447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 
447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 
447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 
447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 
447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>