More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3586 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.32 
 
 		 437 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 423 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  94.33 
 
 		 423 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  41.1 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  38.89 
 
 		 429 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  41.71 
 
 		 437 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  41.71 
 
 		 437 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 439 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  41.33 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 425 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  41.33 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  41.33 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  41.33 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  40.76 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  36.85 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.06 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  40.48 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.14 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.18 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.03 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  32.95 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  31.18 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.68 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  29.38 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  29.94 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 437 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.22 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  26.77 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  29.15 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.29 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.9 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 458 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  28.87 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  30.41 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  30.06 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  30.61 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.07 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  30.24 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  32.05 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  33.54 
 
 		 430 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  30.79 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  28.57 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  28.57 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  33.33 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  36.1 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  33.92 
 
 		 522 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  29.84 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  33.22 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.24 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1288  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 443 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  32.41 
 
 		 438 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>