More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2784 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.32 
 
 		 423 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 437 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  78.55 
 
 		 423 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6994  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  37.1 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.77 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  39.77 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  37.53 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5961  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.616492  normal  0.0368269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 438 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.86 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.02 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  38.2 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  42.12 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  32.66 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  26.93 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  28.2 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  27.27 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  30.36 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  31.18 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  26.37 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  25.93 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  30.84 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  29.79 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  26.15 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  26.81 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  29.85 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  26.15 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  27.5 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  26.37 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  26.72 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  29.29 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  27.54 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  32.19 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  27.47 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1288  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  29.56 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  29.56 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.62 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.53 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  32.99 
 
 		 430 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  30.03 
 
 		 523 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  27.6 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  28.21 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  29.76 
 
 		 522 aa  143  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  28.21 
 
 		 450 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 458 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  31.77 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.43 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  30.77 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0148935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  27.92 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 460 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  30.68 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  29.25 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  31.96 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  30.25 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  28.21 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  28.16 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  28.49 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>