More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1398 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
457 aa  868    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  hitchhiker  0.00733319 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0314  histidine kinase  58.72 
 
 
425 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
477 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.1 
 
 
523 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
455 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  33.72 
 
 
455 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  32.62 
 
 
459 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
586 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
459 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
459 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
459 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
352 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
459 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  32.89 
 
 
344 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  31 
 
 
464 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
457 aa  106  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.85 
 
 
503 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
439 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
429 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  30.72 
 
 
464 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
420 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
421 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
504 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
455 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
455 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
509 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
495 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
551 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
477 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  35.02 
 
 
446 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.09 
 
 
501 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  33.44 
 
 
495 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  33.46 
 
 
459 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.88 
 
 
471 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
453 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.99 
 
 
442 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  33.7 
 
 
473 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0038  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
478 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
427 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
413 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  33.77 
 
 
439 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  30.48 
 
 
457 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.52 
 
 
471 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
457 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  33.22 
 
 
343 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  35.62 
 
 
477 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.11 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
450 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.05 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
480 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
460 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  32.83 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
454 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  34.32 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
463 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.88 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  34.72 
 
 
466 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
517 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
459 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  31.71 
 
 
474 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
450 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  35.56 
 
 
471 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
498 aa  97.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  31.71 
 
 
474 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
532 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
532 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
513 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  32.53 
 
 
474 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  28.27 
 
 
366 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  28.27 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  28.27 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
469 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  28.27 
 
 
366 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  31.74 
 
 
474 aa  96.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  32.18 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  32.18 
 
 
474 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
431 aa  96.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
454 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  32.18 
 
 
474 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  31.07 
 
 
471 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.41 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>