More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3037 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
509 aa  970    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  53.31 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  63.06 
 
 
477 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  52.84 
 
 
494 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
534 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.33 
 
 
532 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.33 
 
 
517 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.29 
 
 
532 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.64 
 
 
552 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 
612 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.47 
 
 
546 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  58.43 
 
 
506 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  59.78 
 
 
473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  44.21 
 
 
497 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
510 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  44.71 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  53.42 
 
 
469 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
502 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 
515 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5254  histidine kinase  47.29 
 
 
545 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118583  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
474 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11050  two component system sensor histidine kinase trcS  46.26 
 
 
509 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
479 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
460 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  41.18 
 
 
492 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  45.1 
 
 
477 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  38.67 
 
 
487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 
545 aa  216  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
601 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.18 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
502 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
535 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  44.92 
 
 
485 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  37.45 
 
 
496 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  41.41 
 
 
520 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
468 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
473 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
473 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
473 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  45.61 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  37.88 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  36.2 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  34.68 
 
 
559 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
529 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
490 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  40.9 
 
 
469 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
474 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
428 aa  190  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  38.78 
 
 
540 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  37.8 
 
 
471 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  45.1 
 
 
550 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
505 aa  187  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
635 aa  187  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.29 
 
 
503 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  44.74 
 
 
505 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  33.7 
 
 
648 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
480 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.26 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
504 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
504 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  41.13 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  40.69 
 
 
587 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
509 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.69 
 
 
587 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
587 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  40.69 
 
 
587 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
459 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.42 
 
 
490 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  37.27 
 
 
477 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
471 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
425 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  40.62 
 
 
525 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  37.63 
 
 
473 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
466 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
469 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
489 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.79 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
468 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
475 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
815 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
384 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  36.42 
 
 
508 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>