More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0314 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0314  histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  811    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.44 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  hitchhiker  0.00733319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  32.57 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 545 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.29 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 504 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  35.02 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.48 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 478 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  34.5 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.55 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  30.68 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 463 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  34.39 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.47 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.46 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 586 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 479 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 532 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  31.21 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  37.79 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  29.05 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3034  histidine kinase  34.38 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2806  histidine kinase  32.91 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.295949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.92 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 490 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 450 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  35.21 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.08 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  31.25 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  30.66 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  29.66 
 
 		 474 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  32.23 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 585 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.8 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.8 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  31.77 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  33.93 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 510 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.85 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.31 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  28.82 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  31.29 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  27.8 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  32.75 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 476 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  27.86 
 
 		 474 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  31 
 
 		 457 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.73 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 		 488 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.73 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  35.5 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.46 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.51 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>