More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0303 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  775    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0784  histidine kinase  38.44 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0431535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  29.83 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.01 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  29.48 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  32.9 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 470 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  23.79 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  27.02 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 420 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 465 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  24.04 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.2 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 524 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 504 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3687  histidine kinase  28.7 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.1 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.71 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  24.58 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  26.14 
 
 		 555 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  24.42 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.16 
 
 		 461 aa  99.8  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 601 aa  99.8  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.16 
 
 		 461 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 460 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 723 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.54 
 
 		 584 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0314  histidine kinase  28.77 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  23.6 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  25.64 
 
 		 472 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  23.18 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  25.98 
 
 		 592 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  23.55 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 484 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  22.33 
 
 		 544 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 484 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.26 
 
 		 453 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 484 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 545 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  30 
 
 		 482 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  24.56 
 
 		 490 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  24.12 
 
 		 481 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  28.51 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  22.99 
 
 		 523 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  22.42 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.07 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  23.55 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  21.68 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  26.37 
 
 		 484 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  27.82 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 484 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  26.58 
 
 		 486 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 462 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  26.37 
 
 		 484 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 484 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  22.49 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 467 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 471 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 479 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 556 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 459 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 458 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>