More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2806 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2806  histidine kinase  100 
 
 
453 aa  907    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.295949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.1 
 
 
442 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
416 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
612 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.57 
 
 
486 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
412 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  31.16 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
509 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  27.11 
 
 
482 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  39.76 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  30.03 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
718 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
933 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  30.49 
 
 
471 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  28.61 
 
 
364 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
517 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  32.58 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  28.61 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.34 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.5 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.34 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.9 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
441 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.16 
 
 
471 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
444 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  32.13 
 
 
340 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
466 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  33.55 
 
 
494 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
701 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
695 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
469 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
571 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
472 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.23 
 
 
477 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.91 
 
 
477 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.74 
 
 
481 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
471 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
551 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
587 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
422 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  31.19 
 
 
480 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  32.73 
 
 
515 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  32.14 
 
 
483 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  37.94 
 
 
433 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
346 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
462 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
585 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  30.31 
 
 
449 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  33.44 
 
 
559 aa  107  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.71 
 
 
468 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
462 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  33.21 
 
 
506 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  32.64 
 
 
471 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
423 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
446 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
450 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  35.77 
 
 
346 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
446 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
346 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0478  histidine kinase  35.2 
 
 
438 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.05 
 
 
461 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.11 
 
 
496 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
350 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.42 
 
 
463 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.09 
 
 
490 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
473 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
455 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
455 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
454 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.91 
 
 
455 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
490 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  36.18 
 
 
463 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
475 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.39 
 
 
461 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
785 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
473 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
473 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  36.6 
 
 
367 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
468 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  35.77 
 
 
353 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
473 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
473 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  29.91 
 
 
506 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.75 
 
 
461 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
489 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  36.12 
 
 
346 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.58 
 
 
453 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.75 
 
 
461 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
394 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>