More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0823 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 488 aa  973    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.26 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  51.05 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 522 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 515 aa  296  7e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  52.22 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  43.01 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 488 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 505 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 545 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  37.6 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  47.71 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  45.97 
 
 		 477 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  46.49 
 
 		 505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  46.9 
 
 		 477 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 529 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 528 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  48.43 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  38.56 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  44.39 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 490 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  45.65 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  39.96 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.21 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 552 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  45.17 
 
 		 550 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 612 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  42.74 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  43.14 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  39.44 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  41.62 
 
 		 559 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  36.33 
 
 		 497 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 532 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 532 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 635 aa  207  5e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  38.48 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  37.45 
 
 		 494 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  43.24 
 
 		 477 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  42.02 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  34.41 
 
 		 648 aa  190  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  38.24 
 
 		 481 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.2 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.7 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  41.36 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  36.65 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  39.77 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.45 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  42.31 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.88 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 639 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 639 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 498 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 639 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 607 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 466 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  38.87 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 513 aa  160  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>