More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4577 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  98.9 
 
 		 363 aa  730    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  99.18 
 
 		 366 aa  737    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  86.03 
 
 		 359 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  86.03 
 
 		 359 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  100 
 
 		 366 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  99.45 
 
 		 366 aa  739    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  99.17 
 
 		 363 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  99.18 
 
 		 366 aa  737    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  99.17 
 
 		 363 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  86.03 
 
 		 359 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  98.9 
 
 		 363 aa  730    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  86.03 
 
 		 359 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  86.49 
 
 		 349 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3837  sensor protein BasS/PmrB  56.94 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4017  sensor protein BasS/PmrB  56.94 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0309  sensor protein BasS/PmrB  52.44 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.327284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  49.41 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  49.41 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0391  sensor protein BasS/PmrB  51.59 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0477  sensor protein BasS/PmrB  52.38 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000367453  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3618  sensor protein BasS/PmrB  49.7 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000754738  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  33.23 
 
 		 454 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 466 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.84 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 517 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 487 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 519 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  31.15 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 515 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2785  sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 512 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 523 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 518 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 		 817 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.06 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 505 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.08 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  34.74 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.63 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 524 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.3 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  32.92 
 
 		 500 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.68 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 494 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  32.98 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  29.8 
 
 		 495 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.33 
 
 		 474 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.21 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 450 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.21 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.58 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 435 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 435 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  29.88 
 
 		 518 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.12 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  30.96 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 531 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 467 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 501 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  29.28 
 
 		 526 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 560 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 457 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 517 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 501 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 465 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1129  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 467 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.81 
 
 		 513 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 466 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  34.78 
 
 		 469 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  32.28 
 
 		 465 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>