More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0391 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0391  sensor protein BasS/PmrB  100 
 
 
361 aa  733    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0309  sensor protein BasS/PmrB  79.38 
 
 
385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.327284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4017  sensor protein BasS/PmrB  62.75 
 
 
364 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3837  sensor protein BasS/PmrB  62.5 
 
 
362 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  51.87 
 
 
366 aa  352  8e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  51.87 
 
 
366 aa  352  8e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  51.59 
 
 
363 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  51.59 
 
 
363 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  51.59 
 
 
366 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  51.59 
 
 
363 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  51.59 
 
 
363 aa  348  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  51.59 
 
 
366 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  49.86 
 
 
359 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  49.57 
 
 
359 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  49.86 
 
 
359 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  49.86 
 
 
349 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  50 
 
 
359 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  50.75 
 
 
355 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  50.75 
 
 
355 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0477  sensor protein BasS/PmrB  52.68 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000367453  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3618  sensor protein BasS/PmrB  47.58 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000754738  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.06 
 
 
515 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
515 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
413 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
466 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  33.57 
 
 
471 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.13 
 
 
513 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  33.57 
 
 
471 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  34.78 
 
 
438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
455 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
456 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.03 
 
 
499 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
450 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
517 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
519 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.97 
 
 
454 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  32.34 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  28.95 
 
 
501 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  34.12 
 
 
519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.88 
 
 
478 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  34.33 
 
 
480 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  27.99 
 
 
495 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  28.42 
 
 
526 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  29.43 
 
 
469 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.88 
 
 
478 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  33.21 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.34 
 
 
517 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
505 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  28.71 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.69 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
505 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
505 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  29.47 
 
 
476 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  28.1 
 
 
523 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
518 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
505 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  33.57 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  31.55 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1129  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  31.73 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  27.74 
 
 
817 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  30.59 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
485 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
465 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  31.07 
 
 
459 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  32.89 
 
 
452 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
454 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  28.1 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
454 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  27.91 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  30.39 
 
 
496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
476 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
453 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
450 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>