More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0254 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  100 
 
 
459 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  99.78 
 
 
459 aa  910    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  100 
 
 
459 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  100 
 
 
459 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  99.78 
 
 
459 aa  910    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0038  sensor histidine kinase  94.99 
 
 
459 aa  736    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  99.78 
 
 
459 aa  910    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  99.78 
 
 
459 aa  910    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.18 
 
 
477 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.4 
 
 
455 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.52 
 
 
455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.4 
 
 
455 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.18 
 
 
455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  74.62 
 
 
455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.18 
 
 
455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  55.7 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  54.75 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  55.7 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  45.53 
 
 
483 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  44.66 
 
 
483 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
457 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
462 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  39.08 
 
 
467 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
465 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
469 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.25 
 
 
496 aa  249  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  38.1 
 
 
473 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.96 
 
 
497 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  36 
 
 
495 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  37.16 
 
 
472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.02 
 
 
500 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.11 
 
 
499 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.12 
 
 
501 aa  227  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.15 
 
 
472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
524 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
463 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.28 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.05 
 
 
513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
523 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
471 aa  219  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
476 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  36.44 
 
 
518 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  35.99 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
515 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
505 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
505 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
505 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  37 
 
 
506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  36.53 
 
 
517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
517 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  36.53 
 
 
817 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
519 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  34.91 
 
 
526 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  36.24 
 
 
517 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
517 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
517 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
478 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
531 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.85 
 
 
439 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.23 
 
 
515 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
515 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
515 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
509 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
501 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  35.78 
 
 
508 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
458 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
458 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
456 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  35.15 
 
 
460 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  41.07 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
459 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  32.46 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  36.02 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
459 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  33.26 
 
 
481 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
493 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>