45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0280 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  902    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  39.57 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  28.41 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  35.76 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  37.78 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  44.19 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.76 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  49.5 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  52.88 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  41.56 
 
 		 86 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  44.62 
 
 		 85 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  52 
 
 		 86 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  37.88 
 
 		 178 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  31.28 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  32.8 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 83 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  51.02 
 
 		 66 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 		 97 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 354 aa  51.6  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  56.25 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  51.02 
 
 		 127 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  33.09 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.75 
 
 		 127 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 		 398 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  40.82 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  48.94 
 
 		 77 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  34.69 
 
 		 174 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.78 
 
 		 92 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  45.1 
 
 		 184 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.73 
 
 		 71 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 114 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 127 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  42.31 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 107 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 481 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 190 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 86 aa  43.5  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  40.43 
 
 		 194 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>