58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5231 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 474 aa  913    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  40.72 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  41.83 
 
 		 555 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  32.61 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  34.52 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  29.7 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  29.66 
 
 		 127 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  34.72 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 98 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.16 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 92 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 71 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  38.81 
 
 		 127 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 127 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  28.11 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  30.99 
 
 		 86 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  40.98 
 
 		 240 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 177 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 174 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 97 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  31.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  37.21 
 
 		 114 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  34 
 
 		 124 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 68 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 		 61 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  42.86 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 103 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  47.92 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  36.22 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  31.09 
 
 		 847 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 119 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 65 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 96 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  31.33 
 
 		 84 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 306 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  31.54 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 169 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 96 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 85 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 81 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 58 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  33.93 
 
 		 244 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  40.51 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35.59 
 
 		 82 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 184 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 164 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 62 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  42.31 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 152 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  26.57 
 
 		 547 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  27.85 
 
 		 76 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 161 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>