69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3000 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 547 aa  1068    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  53.6 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  31.7 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  49.61 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.2 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2545  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  29.62 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0279  phage shock protein C, PspC  50.5 
 
 		 136 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00594777  normal  0.0301661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  45.57 
 
 		 86 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  28.21 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  24.62 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.7 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 85 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  41.03 
 
 		 83 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  30.88 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 96 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  26.67 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 71 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  34.31 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 178 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  46 
 
 		 86 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 92 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  41.51 
 
 		 96 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 98 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 127 aa  50.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 177 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 138 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  41.07 
 
 		 127 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.82 
 
 		 129 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  50.85 
 
 		 164 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 107 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 847 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  36.25 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 114 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 143 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 		 169 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  42.86 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  35.59 
 
 		 244 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.83 
 
 		 81 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 127 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  39.71 
 
 		 100 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.73 
 
 		 174 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  44.68 
 
 		 77 aa  47.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 		 103 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 233 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 76 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  39.22 
 
 		 85 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  50.98 
 
 		 67 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 66 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 194 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 65 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  29.55 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 82 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  37.5 
 
 		 82 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  44.3  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 		 87 aa  44.3  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 416 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 400 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>