66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09558 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1186    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  42.07 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  30.43 
 
 		 601 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  27.86 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  28.72 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  28.61 
 
 		 847 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  23.54 
 
 		 847 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  26.46 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  29.19 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 		 95 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  32.73 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  45.76 
 
 		 82 aa  62  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 61 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  25.11 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 84 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 103 aa  54.3  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 127 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 71 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 77 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  33.85 
 
 		 70 aa  52  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 65 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 152 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  48.89 
 
 		 96 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 85 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 92 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 169 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  30.56 
 
 		 119 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  31.43 
 
 		 143 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 170 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 512 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 165 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 68 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 138 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  37.14 
 
 		 178 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  38.98 
 
 		 81 aa  47.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  38.98 
 
 		 148 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 533 aa  47.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 174 aa  47  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 87 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 76 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  41.38 
 
 		 127 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  42.59 
 
 		 136 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  30.26 
 
 		 86 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  35.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  35.59 
 
 		 79 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 61 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  36.67 
 
 		 70 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  28 
 
 		 128 aa  45.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 86 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 98 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 86 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 86 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  36.67 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 64 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 153 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 81 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>