57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4529 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 400 aa  813    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  26.96 
 
 		 578 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  29.19 
 
 		 582 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 847 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  27.85 
 
 		 601 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  29.6 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.16 
 
 		 515 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  34.1 
 
 		 847 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  24.2 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  42.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 71 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  50.98 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 74 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 62 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  40.22 
 
 		 81 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 66 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 95 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  52.08 
 
 		 92 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35.82 
 
 		 82 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 68 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  32.29 
 
 		 177 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 67 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 103 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 		 64 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  28.57 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  35.09 
 
 		 61 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  28.44 
 
 		 174 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  44.07 
 
 		 127 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 61 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  54.05 
 
 		 86 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  48.84 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  54.05 
 
 		 86 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  51.22 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.94 
 
 		 129 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  63.64 
 
 		 86 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 		 64 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 81 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 96 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 132 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.43 
 
 		 85 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  51.22 
 
 		 445 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 119 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  39.13 
 
 		 86 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>