175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0849 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
147 aa  290  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  37.86 
 
 
127 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  37.14 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  60.66 
 
 
61 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  54.69 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  32.91 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  44.16 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.05 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  43.42 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  40.51 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  45.83 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  49.18 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  50.77 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  48.21 
 
 
240 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  48.44 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  46.43 
 
 
61 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  46.43 
 
 
61 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 
61 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  46.43 
 
 
61 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  46.43 
 
 
61 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  52.46 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  53.06 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  41.54 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.08 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  41.07 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  41.07 
 
 
61 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  41.07 
 
 
61 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  41.07 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.46 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
398 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.85 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  54.55 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  30.85 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  44 
 
 
77 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  57.5 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.1 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  42.5 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  46.84 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  39.47 
 
 
555 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.22 
 
 
416 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  30.43 
 
 
847 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  38.24 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  32.24 
 
 
207 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  26.87 
 
 
419 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 
248 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  27.55 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.13 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  41.38 
 
 
244 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  32.26 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  28.31 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.38 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  36.76 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.91 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  42.59 
 
 
511 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.91 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  36.92 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.91 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 
474 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  42.25 
 
 
233 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
466 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  31.18 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  28 
 
 
515 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  42.59 
 
 
445 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  47.73 
 
 
464 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  35 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  34.52 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.96 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  32.98 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  32.98 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.83 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  32.98 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 
346 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>