93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4332 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
61 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  96.72 
 
 
61 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  96.72 
 
 
61 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  93.44 
 
 
61 aa  116  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  93.44 
 
 
61 aa  116  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  85.25 
 
 
61 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  55 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  53.45 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
58 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
194 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.98 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 
85 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  45 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  44.26 
 
 
62 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  42.37 
 
 
244 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 
847 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  47.73 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  46.55 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  58.33 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
143 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  38.18 
 
 
419 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 
233 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  52.17 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  58.33 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
398 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  32.76 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  33.9 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 
578 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  34.48 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 
76 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  30.36 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 
847 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 
416 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  39.68 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  41.67 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  51.52 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  33.9 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  30.36 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  35.19 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  35 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  35.85 
 
 
555 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  36.21 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.19 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.19 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  35 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  43.59 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  44.19 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  31.67 
 
 
582 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  38.81 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>