50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  28.65 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  39.74 
 
 		 95 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  43.75 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  37.66 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 61 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  39.47 
 
 		 515 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 177 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  29.46 
 
 		 170 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  39.66 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 68 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  31.62 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 71 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  28.48 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 416 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 92 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 61 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 86 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5724  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 383 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  31.82 
 
 		 582 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 86 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 67 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 601 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  29.58 
 
 		 578 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 83 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  32.17 
 
 		 445 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  34.85 
 
 		 70 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  34.62 
 
 		 66 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 62 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  39.22 
 
 		 81 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  28.83 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  34.43 
 
 		 127 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 65 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 511 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  31.2 
 
 		 138 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 		 87 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  33.85 
 
 		 103 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 394 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  28.4 
 
 		 96 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 394 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 174 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>