125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0783 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 601 aa  1227    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  30.81 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  29.38 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  30.53 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  27.52 
 
 		 452 aa  157  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  29.88 
 
 		 847 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  24.85 
 
 		 351 aa  110  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  23.03 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  27.46 
 
 		 400 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 71 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  49.12 
 
 		 61 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  44.07 
 
 		 95 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  36.25 
 
 		 82 aa  67  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 		 66 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  44.12 
 
 		 86 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  51.72 
 
 		 68 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  43.28 
 
 		 92 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  41.67 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  49.12 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 		 85 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.81 
 
 		 86 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.71 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  52.08 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 61 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  41.54 
 
 		 81 aa  57  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  44.07 
 
 		 61 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  44.07 
 
 		 61 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 127 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 65 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  36.14 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 64 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 103 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  34.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  43.1 
 
 		 127 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42.47 
 
 		 138 aa  55.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 62 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  36.47 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  41.67 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  36.99 
 
 		 119 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 98 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  33.1 
 
 		 152 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  25.95 
 
 		 147 aa  53.9  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 87 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 169 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 97 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  45.76 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  29.59 
 
 		 96 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  39.78 
 
 		 124 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  44.64 
 
 		 129 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 394 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  53.85 
 
 		 96 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 86 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 96 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  41.38 
 
 		 79 aa  51.6  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 184 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 346 aa  51.2  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  33.67 
 
 		 165 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  37.14 
 
 		 76 aa  50.4  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 86 aa  50.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  54.05 
 
 		 86 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  32.31 
 
 		 70 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 107 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 86 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  35.94 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 		 233 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 		 77 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  38.36 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  24.39 
 
 		 128 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  24.39 
 
 		 128 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0967  PspC domain-containing protein  45.31 
 
 		 108 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0365366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  34.78 
 
 		 178 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  28.18 
 
 		 114 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 207 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 59 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  26.45 
 
 		 131 aa  48.5  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  23.58 
 
 		 128 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 67 aa  48.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 481 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  23.58 
 
 		 128 aa  47.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  29.03 
 
 		 124 aa  47.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 400 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>