62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1158 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 124 aa  256  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  51.59 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  32.28 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  32.59 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  29.61 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  31.54 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  34.88 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  32 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  32.85 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  34.65 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  32.35 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 578 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  34.85 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  40 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0386  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.656365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  29 
 
 		 515 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  25.69 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 394 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  26.45 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.23 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 398 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  33.9 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  26.53 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1801  phage shock protein C, PspC  32.41 
 
 		 193 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.830677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  28 
 
 		 582 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1223  phage shock protein C, PspC  28.43 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  32.5 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  36.47 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  31.18 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  43.08 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  42 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  30.51 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  34.78 
 
 		 70 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 423 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>